서품 후 용산 예수성심신학교의 교수로 부임한 한기근 신부는 1902년에 황해도 황주 본당 초대 주임으로 전임되었으나, 본당 사목 경험이 없었기 때문에 약 3개월 동안 봉산(鳳山) 검수 본당의 이종국(李鍾國, 바오로) 신부의 보좌로 활동하다가 황주군 황주읍 남문 밖 외남부 마을에 한옥을 마련하고 본격적인 활동을 시작하였다. 그러나 해서 교안(海西敎案)이 확대되면서 1902년 6월 박정모(朴貞模) 등이 한 신부의 집을 습격하여 한 신부와 신자들을 위협하는 사건이 발생하였다. 이 사건이 해결된 후 한 신부는 1904년 2월 본당을 황주군 삼전면 외송리 적은동으로 이전하였고, 그곳에서 사목 활동과 함께 해성학교(海星學校)를 설립하는 등 교육 사업에도 힘을 쏟았다.
뿐만 아니라 한기근 신부는 1907년에 《예수진교사패》(耶蘇真教四牌)를 번역 · 간행하였고, 이어 성서의 한글 번역 작업에도 적극 참여하였다. 그리하여 1909년에는 마르코 · 요한 · 루가 복음서의 역주를 완료하였고, 이어 1910년 7월에 4복음서의 교열 작업까지 마침으로써 그해 12월 《ᄉᆞᄉᆞ성경》(四史聖經)이 간행되는 데에 큰 몫을 담당하였다. 그리고 《ᄉᆞᄉᆞ성경》을 번역하면서 한글 띄어쓰기와 보조 부호 사용 원칙인 <우리말 띄어쓰기의 원칙>을 작성하였는데, 출판물에 띄어쓰기가 보편화되지 않았던 당시 상황에서 이러한 연구는 국문학적으로도 주목할 만한 성과였다. 아울러 1910년에 간행된 《요리강령》(要理綱領)과 1911년에 간행된 《성 바오로 수녀회 규구》 등도 한 신부가 번역한 것이었다.
1911년에 한기근 신부는 본당을 다시 황주군 구락면 인훈리 원동으로 이전하였고, 1913년 5월에는 경향잡지사 제2대 사장으로 임명되어 《경향잡지》와 성서 출판소를 담당하게 되면서 황주 지역을 떠나게 되었다. 이후 한 신부는 1922년에 《종도행전》(宗徒行傳)을, 1923년에는 《성체 조배》(聖體朝拜)를 번역 · 간행하였고, 1924년부터는 샬트르 성 바오로 수녀회의 지도 신부를 겸하였다. 또한 기해 · 병오박해 순교자 79위의 시복(諡福) 작업에도 관여하여 이들에 대한 증언을 라틴어로 옮겼으며, 한문으로 된 순교자들의 문초 기록도 번역하였다. 그리고 1925년 7월에는 로마에서 거행된 79위 시복식에 한국 성직자 대표로 참석하였고, 시복식이 끝난 후에는 뮈텔 주교 등과 함께 교황을 알현하고 한국 신부들의 편지를 바쳤다.
1934년에 한기근 신부는 연로한 나이 때문에 경향잡지사를 그만두고, 이어 1939년 봄에는 수녀회 지도 신부도 사임한 뒤 성서 출판소 일에만 전념하였다. 그러다가 1939년 10월 21일 기관지 천식으로 명동 성모병원에서 선종하였고, 유해는 10월 23일 용산 성직자 묘지에 안장되었다. (→ 《사사성경》 )
※ 참고문헌 Liste Des Elèves de Pinang et Liste Des Elèves du G. Sèminaire De Ryong-San/ 《가톨릭 사전》/ 《교회와 역사》 12호(1976.9) · 52호(1979.12) · 56호(1980.4) · 62호(1980.10) · 357호(2005.2), 한국교회사연구소/ 《경향잡지》 566호(1935.5.31) · 912호(1939.10.28) · 1226호(1970.5), 경향잡지사/ 《黃海道 天主教會史》, 黃海道 天主教會史 刊行事業會, 1984/ 《한국 샬트르 성 바오로 수녀회 100년사》, 샬트르 성 바오로 수녀회 100년사 편찬위원회, 1991/ 《뮈텔 주교 일기》 5, 한국교회사연구소, 1998. 〔梁仁誠〕